Хотя, если честно, то слово "настроил" как-то слишком грозно звучит относительно того, что я делал в дебиане по сравнению с настройкой чего либо в генту. По сути я поставил пакет, посмотрел как в первой ссылке из гугла предлагается настроить, сделал по этому мануалу два файла /etc/default/deluge-daemon и одноименный в /etc/init.d/ — в первом указал пользователя и надо/не_надо автозапуск, во второй закинул скрипт, предложенный в мануале. Добавил линки с помощью update-rc.d и запустил service deluge-daemon start.
Совсем скучно как-то, хоть и работает. Надо потом будет научиться писать инит-скрипты для дебиана. Там есть образец /etc/init.d/skeleton, вот надо бы там разобраться что к чему, а там глядишь и systemd понравится.
Алсо линк на мануал по настройке, может еще пригодится newalive.net