Починил NetBeans. Проблема оказалось в том что в скрипт иниализации значения -J-Xmx не бралась з конфига /etc/netbeans.conf , а каждый раз генерилась автоматом исходя из текущих параметров системы. Я конечно понимаю, что чем ольше памяти тем лучше быстрее и удобнее, но выделать 3.5 Гб из 4х доступных — ИМХО бред