to post messages and comments.

← All posts tagged химия

Есть у меня 4-гидрокси-3,5-динитрофенилацетат. Хочу из него получить 1,4-диметокси-3,5-динитробензол. То есть оторвать ацетил и заметилировать гидрохинон по обоим свободным фенолам. С одной стороны интуиция подсказывает мне взять раствор субстрата (например в ацетоне), взять карбонат калия, взять диметилсульфат, смешать всё и оставить крутиться на ночь. С другой стороны автор статьи в которой я подсмотрел получение самого 4-гидрокси-3,5-динитрофенилацетат, метилирует его диазометаном. Чего мне делать очень не хочется. И никому хотеться не должно. Что бы мне со всем этим сделать?

Есть у меня грамм пять серотонин креатинин сульфата. Почему в таком странном виде? Понятия не имею. Видимо это как-то связано с мозгами телят переработанных на серотонин. Вопрос в том как бы мне отмыть серотонин от креатинина. Мне серотонин для синтеза и там креатинин как корове седло. Как вариант всегда есть возможность провести синтез так, а смесь продуктов потом расхроматографироват, но это so unclean.

В догонку к #2852982. Я на самом деле тупой, а автор — котик. Он берёт не два моля боргидрида, а «большой избыток» при помощи которого быстро восстанавливает избыток бензальдегида в системе предотвращая повтороное образование имина. Это 1) правда работает 2) нереально круто 3) просто как валенок. Таким образом можно вводить в первичные амины один заместитель без страданий с защитными группами или использования тяжёлой артилерии. Жалко что с водным формальдегидом скорее всего не взлетит, а безводного — не бывает.

elegant-nmr.com — вот эта вот штука рискует быть примером революции в индустрии (в данном случае в органическом синтезе) при полном отсутствии революции в технологии. Если коротко, то любой человек, который занимается синтезом, не сидит на ЯМР-спектрометре в институте и имеет лишние^W500 евро, купит это устройство рано или поздно. Теперь не коротко.

Краткий экскурс в историю проблемы. ЯМР один из немногих методов что-то понять о структуре вещества, которое ты сварил (есть ещё рентгеноструктурный анализ кристалла и масспектр высокого разрешения). Традиционно ЯМР-спектрометры делают на сверхпроводящих магнитах и представляют собой обычно огромную катушку проволоки, спрятанную в ещё более огромный сосуд дюара в котором жидкий азот охлаждает жидкий гелий. Что значит огромный? Небольшой современный ЯМР спектрометр с удовлетворительной разрешающей способностью (в итоге мы имеем на руках спектр, на котором наблюдаем пики, которые в зависимости от структуры вещества могут быть расположены очень плотно и в зависимости от разрешающей способности прибора быть раздельными пиками или невнятной кашей) по размеру сопоставим с серверной стойкой. Хороший современный ЯМР-спектрометр с хорошей разрешающей способностью по высоте занимает два этажа жилого дома, а для тех, которые находятся на переднем краю технологии строят отдельные здания. Стоимость ЯМР-спектрометра безумна вполне типичным для научного оборудования образом, но тут есть одно маленькое отличие: в него надо регулярно подливать жидкий гелий (обычно раз в год) и жидкий азот (обычно раз в месяц) в количестве сотен литров в зависимости от размеров (и качества) дюара. Причём даже если вы вообще не пользуетесь прибором, снимаете по спектру раз в несколько месяцев, поддерживать температуру сверхпроводящего магнита всё равно придётся. В противном случае он быстро-решительно превратит свою энергию в тепло, испарит весь азот-гелий и превратится в кирпичь. Возможно его удастся после этого перезапустить (пусконаладка после квенча сопоставима с ценой нового прибора). Возможно — нет. В какой-то момент до химиков дошло, что для работы с низкомолекулярными соединениями (всё что меньше килодальтона) им не нужна такая высокая ларморова частота достающаяся столь дорогой ценой и на рынки стали появляться относительно небольшие приборы с частотой 200-300Mhz и сравнительно небольшими дюарами (и ценой). Несколько лет назад я видел прибор на очень мощных постоянных который имел ларморова частоту в 100Mhz и умел снимать только довольно хреновые одномерные H1 спектры, но зато его уже можно было поставить в вытяжной шкаф и снимать реакционную массу онлайн.

И тут приходят какие-то хмыри и выкатывают ЯМР спектрометр на постоянных магнитах о 40Mhz ларморовой частоты и такого размера, что его можно спрятать в рукав куртки. С такой разрешающей способностью он вообще не способен снять нормальный протонник. Но хмыри говорят:
— Да кому нужны ваши сраные протонники в 2016ом году? Снимайте двумерную C13 — H1 или H1 — H1 корреляцию! За счёт растягивания по второй координате перекрывающиеся пики разрешаться!
— Но как же с протонами, которые приделаны не к углероду?
— Да и хуй с ними! Положа руку на сердце, ты всё равно как правило их не видишь из-за обменного эффекта с растворителем.
Вообщем я джва года ждал такую игру, все мои коллеги ждали такую игру и так далее. 500 евро? Не смешите меня, я больше денег в год трачу на ЯМР-as-a-service.

Я тут смотрю в статью и вижу как кто-то упорно кладёт на моль восстанавливаемого имина два моля боргидрида натрия. Я чего-то не понимаю в химии боргидрида или чувакам было просто лень навешивать 19 мг и они решили что 75 — полущ?

При всей схожести кулинарии и синтеза, у них совершенно разный субъективный подход к итоговому продукту: всё то что с точки зрения кулинарии является соусом, аппетитной подливкой и прочими красотами с точки зрения синтеза характеризуется терминами смола и коричневое говно.

— Но там же на этикетке должна быть какая-то запись об утилизации?
— Я так себе и представляю какая могла быть запись по утилизации ЛАГа в послевоенные годы: выносишь банку в двор, ставишь в ведро и стреляешь в неё из своего пистолета.

Придумали мы тут с коллегой как вводить ассиметричные заместители в первичные амины комбинаторным способом. И только мы обрадовались, но потом сообразили что надо чем-то защитить индольный амин, да так чтобы боргидридом не восстанавливалось и кислотой не снималось. Груздь.

Есть хроматографическая система (n насосов, манометр, УФ-детектор, коллектор фракций). Помимо перевода сотни дорогих растворителей на говно и разделения веществ по пробирочкам она ещё производит спектр: график поглащения элюента от времени/объёма. Вопрос в том как бы эти данные записать. Ну то есть придумать способ сереализации пары массивов и некоторого количества метаданных (дата, градиент, скорость потока) не сложно, но может быть есть уже какой-то общепринятый формат?

lifescience.opensource.epam.com — Я думал что после того как EPAM купил разработчиков indigotoolkit, то сам проект он умертвил, а останки припрятал по дальним углам интернета. А тут релиз в 2016ом году. Это кстати довольно классный набор мегакостылей, который умеет рисовать улыбочки, конвертировать их из всякого и во всякое и даже вполне сносно OCR-ить органические структурные формулы. И всё это на крестах.

World Health Organization classifies Monsanto’s dihydrogen monoxide as “probably carcinogenic”Отлично же! Понятие канцерагена будет окончательно дискридетировано. Но вообще меня интересует только одно: как эти люди видят отрицательный контроль в эксперименте доказывающем канцерагенность воды.

thesciencepost.com

Каждый раз когда я берусь ставить реакции с трифенилфосфином у меня возникает непонятное чувство беспокойства, выглядящее весь синтез совершенно иррационально. А разгадка простая: если вам надо поставить реакцию с трифенилфосфином не делайте этого! Отмыться от трифенилфосфиноксида будет охренительно трудно, на что бы ваш продукт не был похож. Если у вас есть выбор из трифенилфосфина и водорода в баллоне с пирофорным палладиевым катализатором, выбирайте водород!