KVM
А у kvm(qemu) оказывается есть замечательный параметр -usbdevice tabet. Он позволяет использовать мышку в гостевой системе без необходимости её захватывания. При этом функция захватывания мыши и клавиатуры всё ещё присутствует по нажатию Ctrl+Alt